#1
Nombre del estudiante investigador: Rocío Rivera Valentín
Título del Proyecto:
Generation and Screening of Metagenomic libraires from a tropical forest in Puerto Rico: searching for novel enzymatic capabilities.
El trabajo de ésta estudiante enfocaba dos objetivos principales. En primer lugar la utilización de bibliotecas metagenómicas de pequeño tamaño (hechas con muestras de suelo del Pico del Yunque de PR. En segundo lugar el estudio detallado de dichas bibliotecas para la verificación de capacidades enzimáticas.
En cuanto a la primera parte, Rocío logró extraer DNA de sus muestras de suelo, y las trató con endonucleasas para que los fragmentos fueran excisados, purificados, clonados a un vector y transformados a E. coli. De esto obtuvo varios clones, los cuales aisló para procederle a efectuar distintos experimentos. En la segunda parte se estudiaron bibliotecas metagenómicas previamente creadas por su laboratorio, y les hizo un “screening” de actividad de proteasas, que resultó en posibles clones que próximamente se identificarán.
Entre sus planes futuros está la busqueda de actividad de DNAsas y el análisis de secuencias para la detección de otras secuencias enzimáticas.
Estudiante de Carlos Ríos Ph.D at UPRM
#2
Nombre del estudiante investigador: Jose G Montoyo
Título del Proyecto:
Applying T7 phage display as a chemical combinatorial approach to search for specific biomarkers.
El trabajo de éste estudiante trataba sobre la técnica “phage display”, la cual es un método para el estudio de interacciones que utilizan bacteriófagos para conectar proteínas con la información genética que las codifica. Incluye interacciones tanto proteína-proteína, proteína-péptido y proteína-DNA.
El propósito de Montoyo, era emplear el método en éste proyecto para encontrar un biomarcador específico, y su especificidad por el ligando utilizando un alcanze químico combinatorial. Para hallar el biomarcador, el estudiante llevó a cabo una serie de “biopannings” o lavados que consisten en separar los fagos enlazados de los no-enlazados. Como punto interesante, en su investigación no es una molécula o una proteína lo que sirve como ligando, en cambio es toda una célula. Dirigió sus intenciones a encontrar un biomarcador específico para Staphylococcus aureus y a examinar la especificidad de dos péptidos encontrados en investigaciones previas de Cryptococcus gattii.
Como resultados, luego de dos rondas de “biopanning” varios fagos fueron obtenidos para el aislamiento de biomarcadores específicos. Montonyo también demostró resultados pasados C. gattii.
En experimentos futuros el estudiante espera el análisis in silico de los fagos aislados contra S. aureus, para determinar la identidad molecular de un posible biomarcador.
#3
Nombre del estudiante investigador: Aslin M. Rodriguez-Nassif
Título del Proyecto:
Methodology to assess the inhibition of α-Amylase by Tapeinochilus ananassae extracts.
El trabajo de ésta estudiante trataba sobre la utilización de una planta para pacientes diabéticos y sus posibles efectos. Su estudio fue basado en el análisis de que la obesidad es una variable importante en la diabetes y que para el manejo de la misma se ha sugerido como estrategia la inhibición de α-amilasa para reducir los niveles de azúcar en la sangre. Utilizó la planta Tepeinochilus ananassae, en la cual examinó la inhibición de la enzima por extractos acuosos y metanólicos. También hizo extractos con el flavonoide Quercetin y acarbosa (controles). Con los extractos se calculó el porciento de inhibición de α-amilasa y se encontró que los extractos acuosos y metanólicos tuvieron una relación inversa en cuanto a la respuesta de inhibición enzimática (medida por concentración).
Conclusiones de la estudiante: la inhibición de α-amilasa no es un acercamiento terapéutico útil para el control de la diabetes.
